发病盛期可喷雾1：2：200倍波尔多液，或0.1-0.2波美石硫合剂，或15%可湿性粉锈宁粉剂1000-1500倍液。加强肥水管理，铲除杂草，合理修剪。晚秋及时枯枝落叶杂草并烧毁。栽培抗病品种，可以将抗病能力强的花椒品种混栽。
花椒膏病是花椒的一种常见病，其病原为担子菌亚门的隔担耳。担子果似膏状，紧帖在花椒树枝干上。轻者使枝干生长不良，挂果少；重者导致枝干枯死。在很多地区，花椒枝干及整株枯死，挂果少，结果小都与膏病有关。膏病的发生与树龄、湿度及品种有关。据调查，花椒膏病主要发生在荫蔽、潮湿的成年椒园；另外，该病发生与介壳虫危害有关，膏病以介壳虫分泌的蜜露为营养，故介壳虫危害严重的椒园，膏病发病严重。防治措施：加强管理，适当修剪，除去枯枝落叶，降低椒园湿度。

及时拔除病苗。移苗时用50%托布津500倍液浸根24小时。用生石灰消毒土壤。并用托布津500-800倍液，或15%粉锈宁500-800倍液灌根。4月用15%粉些宁300-800倍液灌根成年树，能有效阻止发病。夏季灌根能减缓发病的严重程度，冬季灌根能减少病原菌的越冬结构。及时挖除病死根，死树，并烧毁，病染原。
花椒锈病是花椒叶部重要病害之一。广泛分布在陕西、四川、河北、甘肃等省的花椒栽培区。严重时，花椒提早落叶，直接影响次年的挂果。发病初期，在叶子正面出现2-3mm水渍状褪绿斑,并在与病斑相对的叶背面出现黄橘色的疱状物，为夏孢子堆。本病由花椒鞘锈菌引起。夏孢子和冬孢子阶段发生在花椒树上。
花椒锈病的发生主要与气候有关。凡是降雨量多，特别是在第三季度雨量多，降雨天数多的条件下，危害很容易发生。防治措施：剂预防：在未发病时，可喷布波尔多液或0.1-0.2%波美石灰硫磺合剂，或在6月初至7月下旬对花椒树用200-400倍液萎锈灵进行喷雾保护。剂防治：对已发病的可喷15%的粉锈宁可湿性粉剂1000倍液，控制夏孢子堆产生。